236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2240 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  66.25 
 
 		 487 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  66.31 
 
 		 507 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  71.3 
 
 		 482 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  71.1 
 
 		 479 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  63.89 
 
 		 487 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  69.23 
 
 		 472 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  66.02 
 
 		 490 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  65.66 
 
 		 494 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  65.66 
 
 		 494 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  94.92 
 
 		 472 aa  926    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  66.31 
 
 		 469 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  69.68 
 
 		 479 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  95.76 
 
 		 472 aa  929    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  66.1 
 
 		 469 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  89.41 
 
 		 472 aa  880    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  92.8 
 
 		 472 aa  906    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  66.03 
 
 		 473 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  64.29 
 
 		 498 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  66.31 
 
 		 469 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1000    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  65.38 
 
 		 491 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  69.66 
 
 		 503 aa  688    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  69.68 
 
 		 479 aa  686    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  64.09 
 
 		 477 aa  644    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  73.46 
 
 		 471 aa  740    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  63.77 
 
 		 470 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  68.12 
 
 		 518 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  64 
 
 		 518 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  66.46 
 
 		 487 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  66.32 
 
 		 485 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  69.26 
 
 		 479 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  63.67 
 
 		 478 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  66.24 
 
 		 470 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  69.46 
 
 		 479 aa  691    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  65.96 
 
 		 476 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  70.68 
 
 		 479 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  64.44 
 
 		 489 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  65.31 
 
 		 476 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  63.03 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  65.1 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  60.91 
 
 		 494 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  64.1 
 
 		 475 aa  626  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  62.39 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  63.03 
 
 		 469 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  63.03 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  64.88 
 
 		 476 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  63.19 
 
 		 486 aa  621  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  63.54 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  62.61 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  64.67 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  64.88 
 
 		 471 aa  621  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  62.39 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  64.67 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  64.67 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  61.12 
 
 		 480 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  63.05 
 
 		 497 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  64.67 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  64.67 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  61.97 
 
 		 469 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  63.06 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  64.67 
 
 		 477 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  64.45 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  64.67 
 
 		 478 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  64.67 
 
 		 478 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  64.67 
 
 		 478 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  64.67 
 
 		 477 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  61.97 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  61.75 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3242  protein of unknown function DUF404  62.05 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.657698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  61.32 
 
 		 479 aa  611  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  62.13 
 
 		 469 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  62.1 
 
 		 471 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  61.11 
 
 		 515 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  61.54 
 
 		 492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  62.17 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  61.23 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  60.9 
 
 		 479 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  61.6 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  60.43 
 
 		 477 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  62.21 
 
 		 481 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  61.28 
 
 		 469 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  61.28 
 
 		 469 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  62.61 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  60.84 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  61.02 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  59.1 
 
 		 488 aa  554  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  56.93 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  56.32 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  55.86 
 
 		 482 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  57.02 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  55.44 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  54.7 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  56.17 
 
 		 476 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  54.37 
 
 		 482 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  55.01 
 
 		 482 aa  529  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  55.65 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  56.26 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  54.58 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  53.65 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  53.85 
 
 		 501 aa  512  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>