237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1213 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  72.85 
 
 		 553 aa  759    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  73.14 
 
 		 551 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  75 
 
 		 567 aa  781    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  66.8 
 
 		 526 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  75 
 
 		 567 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  77.37 
 
 		 519 aa  791    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 553 aa  1115    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  72.35 
 
 		 606 aa  758    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  75.44 
 
 		 544 aa  789    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  75 
 
 		 567 aa  781    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  62.92 
 
 		 518 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  59.34 
 
 		 520 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  63.05 
 
 		 545 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  62.66 
 
 		 526 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  62.28 
 
 		 552 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  62.81 
 
 		 544 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  58.76 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  55.15 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  54.94 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  55.36 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  54.62 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  53.64 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  52.79 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  54.68 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  52.3 
 
 		 518 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  51.91 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  51.83 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  53.73 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  54.26 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  53.73 
 
 		 489 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  52.46 
 
 		 486 aa  495  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  52.61 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  53.22 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  51.8 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  54.08 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  53.68 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  53.89 
 
 		 479 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  53.22 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  52.9 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  53.76 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  52.23 
 
 		 515 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  53.62 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  52.94 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  51.68 
 
 		 480 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  52.89 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  53.09 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  51.26 
 
 		 480 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  52.04 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  51.61 
 
 		 480 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  52.69 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  54.13 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  52.47 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  50.53 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  52.65 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  53.9 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  52.8 
 
 		 539 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  52.58 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  52.9 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  51.79 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  51.93 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  52.29 
 
 		 518 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  51.79 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  51.79 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  51.16 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  50.75 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  50.32 
 
 		 470 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  50.99 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  53.7 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  52.15 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  52.69 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  53.14 
 
 		 487 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  50.21 
 
 		 482 aa  478  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  50.32 
 
 		 476 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  55.58 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  52.03 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  52.46 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  52.46 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  51.93 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  52.32 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  53.14 
 
 		 487 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  51.79 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  53.4 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  50.21 
 
 		 481 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  51.83 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  54.13 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  49.79 
 
 		 479 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  52.3 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  53.21 
 
 		 476 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  50.43 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  52.58 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  52.99 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  51.4 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  52.48 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  52.78 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  48.25 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  52.35 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  51.4 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  49.79 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  47.29 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  50.43 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>