235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1749 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  80.29 
 
 		 482 aa  829    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  90.25 
 
 		 482 aa  905    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  81.74 
 
 		 482 aa  839    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  89 
 
 		 482 aa  899    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  80.5 
 
 		 482 aa  830    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 482 aa  992    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  60.13 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  59.71 
 
 		 476 aa  611  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  59.96 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  59.66 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  59.96 
 
 		 488 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  59.96 
 
 		 488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  57.69 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  57.75 
 
 		 480 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  57.35 
 
 		 518 aa  568  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  55.32 
 
 		 488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  57.35 
 
 		 498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  58.07 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  56.96 
 
 		 518 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  55.39 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  54.77 
 
 		 480 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  56.71 
 
 		 485 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  55.88 
 
 		 497 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  55.34 
 
 		 482 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  56.48 
 
 		 492 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  56.43 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  55.22 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  56.22 
 
 		 487 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  55.25 
 
 		 478 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  56.41 
 
 		 470 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  55.84 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  55.77 
 
 		 494 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  55.03 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  55.84 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  54.24 
 
 		 484 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  56.05 
 
 		 469 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  55.13 
 
 		 469 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  55.15 
 
 		 494 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  56.05 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  56.6 
 
 		 476 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  56.29 
 
 		 472 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  55.01 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  55.86 
 
 		 472 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  55.86 
 
 		 489 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  54.49 
 
 		 481 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  55.89 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  54.97 
 
 		 486 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  55.98 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  52.6 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  55.44 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  55.86 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  55.86 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  55.15 
 
 		 494 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  54.27 
 
 		 489 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  54.26 
 
 		 476 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  54.58 
 
 		 487 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  52.35 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  55.34 
 
 		 469 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  53.6 
 
 		 481 aa  531  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  52.24 
 
 		 491 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  54.79 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  55.86 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  54.7 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  54.49 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  54.49 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  55.35 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  55.44 
 
 		 472 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  55.65 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  53.99 
 
 		 501 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  55.22 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  55.65 
 
 		 470 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  53.62 
 
 		 503 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  53.19 
 
 		 482 aa  524  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  53.63 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  53 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  53.8 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  53.09 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  52.99 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  53.94 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  53.42 
 
 		 480 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  53.25 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  52.99 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  51.49 
 
 		 477 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  52.89 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  53.85 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  54.05 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  54.05 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  53.85 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  51.47 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  53.8 
 
 		 479 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  52.75 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  53.55 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  52.95 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  52.31 
 
 		 502 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  51.76 
 
 		 499 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  50.85 
 
 		 490 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  53.22 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  52.61 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  52.87 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  55.28 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>