236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3101 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  65.28 
 
 		 482 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  70.83 
 
 		 482 aa  722    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  71.52 
 
 		 482 aa  721    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  65.28 
 
 		 487 aa  653    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  988    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  77.26 
 
 		 484 aa  768    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  63.94 
 
 		 489 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  65.28 
 
 		 487 aa  653    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  68.33 
 
 		 486 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  60.54 
 
 		 501 aa  617  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  60.21 
 
 		 488 aa  609  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  60.68 
 
 		 484 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  57.05 
 
 		 480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  56.84 
 
 		 477 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  56.85 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  57.51 
 
 		 480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  55.35 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  54.7 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  53.68 
 
 		 501 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  54.43 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  55.11 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  53.21 
 
 		 482 aa  535  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  55.46 
 
 		 488 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  53.03 
 
 		 482 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  53.6 
 
 		 482 aa  531  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  53.89 
 
 		 480 aa  535  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  54.78 
 
 		 482 aa  532  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  54.27 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  52.62 
 
 		 476 aa  527  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  53.72 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  53.04 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  53.73 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  54.37 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  52.62 
 
 		 487 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  52.51 
 
 		 497 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  53.21 
 
 		 470 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  53.01 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  52.81 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  53.62 
 
 		 469 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  52.99 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  53.19 
 
 		 470 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  52.39 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  50 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  53.4 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  50 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  52.22 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  50.92 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  53.09 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  53.3 
 
 		 469 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  52.55 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  52.67 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  50.85 
 
 		 481 aa  495  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  51.28 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  51.15 
 
 		 518 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  51.78 
 
 		 478 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  51.78 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  51.91 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  49.59 
 
 		 490 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  52.1 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  51.91 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  51.25 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  49.28 
 
 		 491 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  49.68 
 
 		 490 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  52.12 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  52.19 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  52.34 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  51.91 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  50.95 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  50.64 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  50.53 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  50 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  50.21 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  51.88 
 
 		 487 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  50.11 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  51.88 
 
 		 487 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  50.32 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  49.36 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  50 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  50.64 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  51.7 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  49.69 
 
 		 485 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  49.58 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  49.04 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  50.42 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  50.43 
 
 		 481 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  49.04 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  48.09 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  48.09 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  48.74 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  52.02 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  50.53 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  50 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  48.4 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  48.1 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  48.1 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  48.1 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  49.57 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  48.1 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  48.1 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  50.32 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>