235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0308 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  63.69 
 
 
482 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  68.35 
 
 
489 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  992    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  62.84 
 
 
482 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  61.26 
 
 
486 aa  624  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  62.24 
 
 
484 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  60.21 
 
 
481 aa  609  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  62.03 
 
 
487 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  62.03 
 
 
487 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  61.04 
 
 
482 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  55.46 
 
 
480 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  54.58 
 
 
480 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  55.65 
 
 
501 aa  548  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  54.58 
 
 
480 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  58.48 
 
 
484 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  55.11 
 
 
488 aa  534  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  56.81 
 
 
488 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  57.3 
 
 
477 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  53.68 
 
 
476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  53.39 
 
 
482 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  53.8 
 
 
480 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  52.75 
 
 
482 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  53.05 
 
 
476 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  54.6 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  52.49 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  52.33 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  54.6 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  52.77 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  53.32 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  53.75 
 
 
469 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  50.84 
 
 
501 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  54.06 
 
 
489 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  51.58 
 
 
488 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  52.89 
 
 
471 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  52.3 
 
 
476 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  53.56 
 
 
489 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  53.85 
 
 
472 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  51.72 
 
 
482 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  53.19 
 
 
476 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  52.99 
 
 
472 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  51.58 
 
 
507 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  52.49 
 
 
518 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  52.79 
 
 
472 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  51.07 
 
 
470 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  53.42 
 
 
477 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  52.58 
 
 
471 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  53.12 
 
 
487 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  52.24 
 
 
472 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  53.12 
 
 
487 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  50.96 
 
 
470 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  50.75 
 
 
487 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  52.56 
 
 
469 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  53.22 
 
 
469 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  51.29 
 
 
491 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  52.36 
 
 
469 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  53.43 
 
 
494 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  50.11 
 
 
469 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  49.68 
 
 
469 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  50.32 
 
 
469 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  53.53 
 
 
470 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  52.15 
 
 
469 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  50.42 
 
 
480 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  50.21 
 
 
480 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  51.41 
 
 
482 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  51.08 
 
 
490 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  50.42 
 
 
480 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  49.9 
 
 
497 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  50.11 
 
 
471 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  52.27 
 
 
479 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  51.5 
 
 
469 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  51.9 
 
 
479 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  50 
 
 
464 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  53.32 
 
 
470 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  52.86 
 
 
478 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  51.5 
 
 
469 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  52.33 
 
 
507 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  52.36 
 
 
469 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  49.68 
 
 
471 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  52.58 
 
 
469 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  49.68 
 
 
471 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  51.88 
 
 
494 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  51.88 
 
 
494 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  51.28 
 
 
472 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  50.88 
 
 
515 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  51.4 
 
 
473 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  51.79 
 
 
481 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  49.25 
 
 
476 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  51.61 
 
 
480 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  49.68 
 
 
477 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  49.68 
 
 
478 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  54.28 
 
 
485 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  49.68 
 
 
478 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  49.68 
 
 
478 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  49.68 
 
 
477 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  49.25 
 
 
476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  51.26 
 
 
502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  49.04 
 
 
476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  50.53 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  51.78 
 
 
518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  52.62 
 
 
472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.188349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>