236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0399 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  996    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  65.12 
 
 
482 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  62.02 
 
 
489 aa  601  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  60.83 
 
 
486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  60.84 
 
 
484 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  60.68 
 
 
481 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  61.39 
 
 
482 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  60.72 
 
 
482 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  66.12 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  66.12 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  58.48 
 
 
488 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  54.45 
 
 
480 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  54.24 
 
 
480 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  54.16 
 
 
501 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  54.89 
 
 
476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  53.47 
 
 
501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  53.66 
 
 
482 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  56.42 
 
 
477 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  51.47 
 
 
482 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  52.31 
 
 
482 aa  503  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  54.57 
 
 
480 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  51.8 
 
 
482 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  50.85 
 
 
482 aa  501  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  52.12 
 
 
482 aa  498  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  52.41 
 
 
488 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  52.02 
 
 
481 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  54.59 
 
 
469 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  55.19 
 
 
488 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  52.56 
 
 
482 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  54.13 
 
 
469 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  53.9 
 
 
469 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  52.98 
 
 
469 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  51.26 
 
 
488 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  51.5 
 
 
494 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  51.06 
 
 
469 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  53.36 
 
 
489 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  50.42 
 
 
518 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  50.64 
 
 
469 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  53.05 
 
 
470 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  52.8 
 
 
487 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  53.02 
 
 
487 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  52.04 
 
 
469 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  51.03 
 
 
503 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  49.28 
 
 
490 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  50.43 
 
 
469 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  52.35 
 
 
476 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  50.45 
 
 
475 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  53.18 
 
 
494 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  52.57 
 
 
476 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  49.25 
 
 
470 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  52.82 
 
 
470 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  53.18 
 
 
494 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  52.51 
 
 
487 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  50.54 
 
 
473 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  50.43 
 
 
469 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  52.27 
 
 
491 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  49.9 
 
 
481 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  51.81 
 
 
469 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  50.21 
 
 
469 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  50.72 
 
 
507 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  50.8 
 
 
482 aa  475  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  52.95 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  51.89 
 
 
497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  51.38 
 
 
472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  51.46 
 
 
518 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  47.8 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  50.9 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  49.66 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  50.74 
 
 
488 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  50.34 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  51.03 
 
 
479 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  50.8 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  51.8 
 
 
485 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  50.46 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  50.43 
 
 
502 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  50.92 
 
 
464 aa  465  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  49.89 
 
 
472 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  49.43 
 
 
472 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  48.71 
 
 
470 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  50.57 
 
 
472 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  48.53 
 
 
480 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  49.03 
 
 
478 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  48.53 
 
 
480 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  49.2 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  49.2 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  49.2 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  48.37 
 
 
463 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  49.2 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  48.97 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  50.23 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  50.56 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  50.34 
 
 
486 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  49.2 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  50.9 
 
 
470 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  50.57 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  49.2 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  49.89 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  49.2 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  48.37 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  49.2 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>