236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0231 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  64.42 
 
 
501 aa  649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  83.79 
 
 
476 aa  837    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  100 
 
 
501 aa  1036    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  62 
 
 
480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  61.06 
 
 
477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  60.93 
 
 
480 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  61.15 
 
 
480 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  58.99 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  57.93 
 
 
476 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  57.08 
 
 
476 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  57.2 
 
 
489 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  55.06 
 
 
482 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  57.35 
 
 
482 aa  551  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  55.56 
 
 
482 aa  548  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  55.39 
 
 
488 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  54.05 
 
 
486 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  54.3 
 
 
482 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  54.83 
 
 
482 aa  545  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  53.68 
 
 
481 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  56.09 
 
 
482 aa  541  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  55.88 
 
 
480 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  55.79 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  54.22 
 
 
480 aa  538  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  55.88 
 
 
480 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  55.46 
 
 
482 aa  537  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  55.46 
 
 
480 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  55.91 
 
 
502 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  55.39 
 
 
507 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  53.99 
 
 
482 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  55.2 
 
 
487 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  52.53 
 
 
484 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  53.99 
 
 
482 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  55.2 
 
 
487 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  55.06 
 
 
476 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  54.85 
 
 
499 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  54.16 
 
 
484 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  54.08 
 
 
479 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  55.03 
 
 
487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  53.52 
 
 
475 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  54.3 
 
 
464 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  52.69 
 
 
470 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  52.15 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  52.47 
 
 
469 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  53.45 
 
 
473 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  53.43 
 
 
486 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  52.15 
 
 
476 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  52.46 
 
 
470 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  52.15 
 
 
476 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  52.69 
 
 
469 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  54.43 
 
 
477 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  52.69 
 
 
469 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  52.48 
 
 
479 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  51.72 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  51.93 
 
 
476 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  51.93 
 
 
471 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  53.76 
 
 
481 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  52.67 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  53.08 
 
 
479 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  51.5 
 
 
476 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  51.72 
 
 
478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  51.72 
 
 
471 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  51.72 
 
 
471 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  51.72 
 
 
478 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  53.05 
 
 
478 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  51.72 
 
 
478 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  51.72 
 
 
477 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  51.72 
 
 
477 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  53.12 
 
 
469 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  52.87 
 
 
477 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  51.5 
 
 
471 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  52.85 
 
 
498 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  51.37 
 
 
490 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  50.84 
 
 
488 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  51.94 
 
 
470 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  50.54 
 
 
482 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  52.16 
 
 
469 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  52.15 
 
 
472 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  53.38 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  53 
 
 
472 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  52.84 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  52.1 
 
 
489 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  51.5 
 
 
472 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  52.26 
 
 
469 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  52.26 
 
 
469 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  53.38 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  52.22 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  51.08 
 
 
470 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  50.75 
 
 
477 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  53.09 
 
 
476 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  51.29 
 
 
489 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  52.2 
 
 
487 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  52.3 
 
 
518 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  52.2 
 
 
487 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  50.43 
 
 
469 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  52.79 
 
 
472 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  51.08 
 
 
469 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  52.47 
 
 
471 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  51.93 
 
 
472 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  50.52 
 
 
491 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  51.46 
 
 
488 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>