237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5101 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5101  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 489 aa  954    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  44.7 
 
 		 865 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  41.99 
 
 		 553 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  42.15 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  41.04 
 
 		 544 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  40.96 
 
 		 606 aa  324  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  41.63 
 
 		 518 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  40.93 
 
 		 519 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  40.97 
 
 		 567 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  40.97 
 
 		 567 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  40.97 
 
 		 567 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  43.72 
 
 		 526 aa  322  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  45.13 
 
 		 837 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  44.47 
 
 		 861 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  41.22 
 
 		 520 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  40.76 
 
 		 488 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  40.09 
 
 		 484 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  39.26 
 
 		 551 aa  309  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  42.13 
 
 		 552 aa  307  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  38.38 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  41.14 
 
 		 489 aa  303  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  41.15 
 
 		 545 aa  302  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  38.2 
 
 		 477 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  38.2 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  38.2 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  38.2 
 
 		 477 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  38.53 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  38.53 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  38.53 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  37.53 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  38.32 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  41.16 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  40.13 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  37.1 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  39.87 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  38.57 
 
 		 476 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  39.74 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  39.11 
 
 		 470 aa  296  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  39.74 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  38.57 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  38.36 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  37.61 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  39.83 
 
 		 507 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  41.72 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  39.1 
 
 		 476 aa  292  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  37.47 
 
 		 469 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  39.49 
 
 		 482 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  39.79 
 
 		 480 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  38.16 
 
 		 471 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  38.16 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  38.16 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  38.16 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  37.55 
 
 		 489 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  41.3 
 
 		 539 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  36.55 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  40.04 
 
 		 476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  37.76 
 
 		 492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  40.33 
 
 		 479 aa  289  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  42.01 
 
 		 526 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  39.75 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  38.62 
 
 		 503 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  38.32 
 
 		 469 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  36.94 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  38.08 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  37.08 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  38.19 
 
 		 476 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  41.2 
 
 		 470 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  38.36 
 
 		 480 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  42.71 
 
 		 850 aa  286  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  37.84 
 
 		 479 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  38.03 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  37.45 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  40.58 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  38.14 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1668  protein of unknown function DUF404  41.83 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.325623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  39.09 
 
 		 494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  37.55 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  38.16 
 
 		 480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  37.15 
 
 		 486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  38.11 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  38.94 
 
 		 469 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  38 
 
 		 479 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  36.68 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  39.26 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  38.95 
 
 		 488 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  38.81 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  39.81 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  37.53 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  35.83 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  39.28 
 
 		 470 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  38.59 
 
 		 469 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  35.62 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  38.59 
 
 		 469 aa  280  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  41.46 
 
 		 489 aa  280  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3242  protein of unknown function DUF404  37.55 
 
 		 475 aa  279  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.657698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  37.6 
 
 		 497 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  39.58 
 
 		 482 aa  279  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  37.11 
 
 		 476 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  36.73 
 
 		 501 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  40.44 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>