More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2911 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  100 
 
 		 861 aa  1699    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  53.97 
 
 		 837 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  75.32 
 
 		 865 aa  1247    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  45.91 
 
 		 850 aa  625  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  46.77 
 
 		 606 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  43.74 
 
 		 484 aa  369  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  44.49 
 
 		 477 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  48.41 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  45.95 
 
 		 552 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  47.32 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  46.61 
 
 		 489 aa  366  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  46.9 
 
 		 544 aa  366  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  47.87 
 
 		 526 aa  366  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  47.54 
 
 		 567 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  47.54 
 
 		 567 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  47.54 
 
 		 567 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  43.55 
 
 		 486 aa  364  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  47.32 
 
 		 520 aa  361  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  44.94 
 
 		 469 aa  360  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  43.22 
 
 		 518 aa  360  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  44.61 
 
 		 482 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  43.71 
 
 		 470 aa  359  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  46.04 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  42.41 
 
 		 481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  46.34 
 
 		 553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  43.46 
 
 		 477 aa  356  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  42.95 
 
 		 480 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  43.45 
 
 		 497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  45.92 
 
 		 518 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  42.38 
 
 		 498 aa  354  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  44.89 
 
 		 476 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  44.47 
 
 		 469 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  43.37 
 
 		 480 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  43.13 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  44.35 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  44.26 
 
 		 469 aa  352  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  42.15 
 
 		 479 aa  352  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  45.91 
 
 		 551 aa  352  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  42.14 
 
 		 482 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  41.91 
 
 		 482 aa  350  7e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  43.16 
 
 		 480 aa  350  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  43.74 
 
 		 492 aa  349  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  41.75 
 
 		 501 aa  349  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  43.78 
 
 		 469 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  44.21 
 
 		 469 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  44.14 
 
 		 469 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  44.35 
 
 		 469 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  43.97 
 
 		 476 aa  347  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  47.67 
 
 		 526 aa  347  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  44 
 
 		 488 aa  347  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  44.11 
 
 		 539 aa  347  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  43.19 
 
 		 490 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  42.77 
 
 		 491 aa  346  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  43.74 
 
 		 476 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  41.15 
 
 		 482 aa  345  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  42.68 
 
 		 480 aa  345  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  42.8 
 
 		 479 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  41.42 
 
 		 487 aa  344  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  39.25 
 
 		 482 aa  344  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  39.25 
 
 		 482 aa  344  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  45.44 
 
 		 507 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  42.68 
 
 		 488 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  41.41 
 
 		 481 aa  343  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  42.25 
 
 		 488 aa  343  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  42.49 
 
 		 471 aa  343  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  42.8 
 
 		 489 aa  343  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  42.89 
 
 		 479 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  42.65 
 
 		 478 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  44.28 
 
 		 489 aa  341  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  41.85 
 
 		 469 aa  341  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  44.47 
 
 		 494 aa  340  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  40.43 
 
 		 482 aa  340  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  41.63 
 
 		 469 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  44.47 
 
 		 494 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  43.19 
 
 		 515 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  43.04 
 
 		 472 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  42.03 
 
 		 473 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  42.45 
 
 		 479 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  42.45 
 
 		 479 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  41.63 
 
 		 469 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  44.3 
 
 		 487 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  42.64 
 
 		 482 aa  337  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  39.33 
 
 		 482 aa  337  7.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  43.28 
 
 		 487 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  43.28 
 
 		 487 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  40.84 
 
 		 488 aa  336  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  44.09 
 
 		 487 aa  336  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  42.4 
 
 		 472 aa  335  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  41.42 
 
 		 469 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  42.04 
 
 		 507 aa  334  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  38.84 
 
 		 482 aa  333  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  43.44 
 
 		 485 aa  333  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  42.07 
 
 		 486 aa  333  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  41.79 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  41.33 
 
 		 503 aa  332  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  41.86 
 
 		 480 aa  332  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  42.49 
 
 		 472 aa  332  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  39.24 
 
 		 476 aa  331  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  42.98 
 
 		 518 aa  331  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  42.18 
 
 		 472 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>