More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3394 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  48 
 
 		 837 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  45.79 
 
 		 861 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  47.35 
 
 		 865 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  100 
 
 		 850 aa  1652    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  42.8 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  43.12 
 
 		 526 aa  303  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  42.11 
 
 		 544 aa  300  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  41.98 
 
 		 567 aa  297  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  41.98 
 
 		 567 aa  297  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  41.98 
 
 		 567 aa  297  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  41.42 
 
 		 519 aa  296  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  41.01 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  40.39 
 
 		 606 aa  295  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  40.95 
 
 		 518 aa  290  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  41.61 
 
 		 551 aa  290  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5101  protein of unknown function DUF404  42.47 
 
 		 489 aa  286  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  40.99 
 
 		 539 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  43.57 
 
 		 520 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  40.72 
 
 		 472 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  40.72 
 
 		 463 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  41.63 
 
 		 544 aa  280  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  36.84 
 
 		 469 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  39.58 
 
 		 545 aa  279  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  38.22 
 
 		 477 aa  277  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  37.63 
 
 		 480 aa  277  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  41.05 
 
 		 502 aa  276  9e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  36.63 
 
 		 469 aa  275  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  38.27 
 
 		 479 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  37.5 
 
 		 486 aa  274  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  36.7 
 
 		 475 aa  273  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  40.51 
 
 		 472 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  39.05 
 
 		 488 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  36.67 
 
 		 476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  36.67 
 
 		 476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  40.86 
 
 		 470 aa  271  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  37.15 
 
 		 471 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  37.82 
 
 		 473 aa  270  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  36.73 
 
 		 471 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  37.37 
 
 		 470 aa  269  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  36.25 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  34.86 
 
 		 482 aa  269  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  38.53 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  36.94 
 
 		 476 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  38.82 
 
 		 476 aa  269  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  36.63 
 
 		 476 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  35.89 
 
 		 482 aa  267  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  39.13 
 
 		 480 aa  267  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  39.46 
 
 		 471 aa  267  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  34.95 
 
 		 479 aa  267  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  35.86 
 
 		 469 aa  266  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  36.14 
 
 		 482 aa  266  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  40.14 
 
 		 480 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  38.74 
 
 		 480 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  39.9 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  36.75 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  36.94 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3242  protein of unknown function DUF404  39.76 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.657698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  37.47 
 
 		 489 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  36.73 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  39.53 
 
 		 552 aa  264  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  35.68 
 
 		 503 aa  264  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  35.16 
 
 		 479 aa  264  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  41.2 
 
 		 477 aa  263  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  41.55 
 
 		 499 aa  263  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  34.97 
 
 		 464 aa  264  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  36.27 
 
 		 477 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  36.27 
 
 		 478 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  36.27 
 
 		 478 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  36.27 
 
 		 477 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  36.73 
 
 		 471 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  38.4 
 
 		 476 aa  263  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  41.16 
 
 		 476 aa  263  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  36.73 
 
 		 471 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  39.9 
 
 		 480 aa  263  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  38.98 
 
 		 507 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  34.65 
 
 		 481 aa  263  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  36.73 
 
 		 478 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  34.31 
 
 		 482 aa  261  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  36.82 
 
 		 489 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  38.18 
 
 		 472 aa  261  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  41.77 
 
 		 526 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  37.05 
 
 		 472 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  39.79 
 
 		 497 aa  260  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  36.55 
 
 		 482 aa  260  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  35.37 
 
 		 470 aa  260  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  38.85 
 
 		 488 aa  260  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  37.11 
 
 		 482 aa  259  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  38.8 
 
 		 480 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  39.33 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  35.61 
 
 		 488 aa  259  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  35.94 
 
 		 469 aa  258  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  37.29 
 
 		 518 aa  258  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  36.92 
 
 		 472 aa  258  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  38.39 
 
 		 497 aa  257  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  35.21 
 
 		 501 aa  257  8e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  34.95 
 
 		 482 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  35.83 
 
 		 482 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  36.23 
 
 		 469 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  38.19 
 
 		 477 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  35.8 
 
 		 498 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>