237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2050 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  100 
 
 
497 aa  1009    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  56.28 
 
 
480 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  54.68 
 
 
488 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  57.5 
 
 
488 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  55.23 
 
 
480 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  53.83 
 
 
469 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  54.3 
 
 
477 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  53.96 
 
 
480 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  53.62 
 
 
469 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  53.19 
 
 
469 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  54.11 
 
 
501 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  55.89 
 
 
476 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  56.6 
 
 
476 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  53.86 
 
 
469 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  51.88 
 
 
499 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  52.98 
 
 
469 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  53.57 
 
 
489 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  55.63 
 
 
470 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  54.08 
 
 
488 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  54.04 
 
 
469 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  53.52 
 
 
482 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  55.2 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  50.63 
 
 
476 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  52.02 
 
 
479 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  53.43 
 
 
494 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  55.34 
 
 
480 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  52.08 
 
 
482 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  54.06 
 
 
480 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  52.29 
 
 
482 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  53.22 
 
 
469 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  52.7 
 
 
482 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  52.31 
 
 
502 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  54.19 
 
 
490 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  50.63 
 
 
477 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  51.69 
 
 
482 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  53 
 
 
469 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  53.1 
 
 
567 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  52.14 
 
 
482 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  53.1 
 
 
567 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  51.27 
 
 
484 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  51.61 
 
 
464 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  53.1 
 
 
567 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  51.28 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  51.46 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  50.21 
 
 
469 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  51.25 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  51.71 
 
 
482 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  50.94 
 
 
486 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  54.64 
 
 
479 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  51.04 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  50.43 
 
 
469 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  52.14 
 
 
487 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  52.69 
 
 
482 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  53.32 
 
 
473 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  53.4 
 
 
606 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  50.74 
 
 
479 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  50.42 
 
 
492 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  55 
 
 
479 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  50.21 
 
 
469 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  53.99 
 
 
489 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  52.74 
 
 
479 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  51.71 
 
 
482 aa  487  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  51.82 
 
 
482 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  53.38 
 
 
479 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  52.73 
 
 
518 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  52.49 
 
 
494 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  51.05 
 
 
501 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  52.49 
 
 
494 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  52.48 
 
 
553 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  50.75 
 
 
476 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  52.83 
 
 
479 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  53.19 
 
 
476 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  52.25 
 
 
551 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  49.89 
 
 
481 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  52.83 
 
 
479 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  50.42 
 
 
481 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  52.71 
 
 
491 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  52.56 
 
 
518 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  50.63 
 
 
476 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  52.28 
 
 
507 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  50.53 
 
 
476 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  50.53 
 
 
476 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  52.67 
 
 
544 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  50.53 
 
 
471 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  52.08 
 
 
487 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  52.08 
 
 
487 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  50.63 
 
 
477 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  52.83 
 
 
545 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  49.79 
 
 
470 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  51.84 
 
 
490 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  53 
 
 
471 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  50.32 
 
 
471 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  52.67 
 
 
472 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  52.94 
 
 
498 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  52.77 
 
 
526 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  50.75 
 
 
486 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  48.54 
 
 
488 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  51.81 
 
 
472 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  49.58 
 
 
470 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  50.94 
 
 
488 aa  478  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>