197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1911 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  100 
 
 
378 aa  777    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  67.73 
 
 
375 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  55.5 
 
 
376 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  56.52 
 
 
389 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  40.93 
 
 
390 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  42.65 
 
 
379 aa  292  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  41.5 
 
 
366 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  42.65 
 
 
379 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  40 
 
 
366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  38.54 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.39 
 
 
389 aa  282  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  38.65 
 
 
365 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  41.23 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.73 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.46 
 
 
374 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.37 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.92 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.92 
 
 
380 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.6 
 
 
388 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  40.11 
 
 
410 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.29 
 
 
375 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.74 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.74 
 
 
375 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.64 
 
 
401 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.56 
 
 
366 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.52 
 
 
376 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.97 
 
 
378 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  35.23 
 
 
382 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  34.89 
 
 
380 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.52 
 
 
399 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.49 
 
 
390 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.7 
 
 
390 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  34.89 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  33.42 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.79 
 
 
379 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.81 
 
 
377 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.88 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.43 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  35.26 
 
 
376 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  34.43 
 
 
376 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  34.81 
 
 
376 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  34.81 
 
 
376 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.81 
 
 
388 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  34.81 
 
 
376 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.91 
 
 
377 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  32.88 
 
 
383 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.97 
 
 
382 aa  192  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  36.03 
 
 
404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  36.61 
 
 
378 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31.56 
 
 
383 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  35.67 
 
 
398 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.98 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  32.6 
 
 
363 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  34.3 
 
 
373 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.11 
 
 
388 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  30.41 
 
 
373 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  32.07 
 
 
380 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  28.96 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 
371 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 
368 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 
376 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  29.36 
 
 
371 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 
368 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 
371 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 
372 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  32.32 
 
 
374 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 
372 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 
372 aa  170  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  29.55 
 
 
372 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.55 
 
 
372 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 
372 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 
374 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 
370 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  29.55 
 
 
372 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 
373 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  29.88 
 
 
372 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  29.88 
 
 
372 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  29.88 
 
 
372 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  29.88 
 
 
372 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  29.26 
 
 
372 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.15 
 
 
380 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  29.08 
 
 
371 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.01 
 
 
382 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  30.79 
 
 
865 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  29.57 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  29.27 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  31.9 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  31.9 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.99 
 
 
378 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  27.81 
 
 
375 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.29 
 
 
362 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  32.73 
 
 
364 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  32.73 
 
 
364 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  30.42 
 
 
327 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  29.81 
 
 
387 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  30 
 
 
377 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  30.57 
 
 
360 aa  160  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>