204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2301 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 		 378 aa  772    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.54 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.13 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.01 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.92 
 
 		 374 aa  278  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.47 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  43.87 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  44.35 
 
 		 368 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  44.63 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  43.67 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.56 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  40.17 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.43 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.18 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.18 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.9 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  45.43 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  44.51 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.75 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  37.81 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  34.95 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  38.63 
 
 		 375 aa  222  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.97 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.87 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  35.97 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  32.53 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.52 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  32.79 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  32.51 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.54 
 
 		 367 aa  185  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  32.7 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  32.44 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.12 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.4 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 861 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  32.16 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  32.59 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  31.34 
 
 		 837 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.01 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  31.68 
 
 		 865 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.49 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  32.07 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.05 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.79 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.36 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.68 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.11 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  29.68 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.3 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.87 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.69 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  34.41 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.59 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.11 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  31.38 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.12 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.02 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  32.53 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  32.53 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.53 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.32 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.01 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.32 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.93 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  28.91 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  29.32 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.26 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  29.11 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.12 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.17 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  28.71 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  26.77 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.64 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  26.76 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.38 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  26.76 
 
 		 374 aa  136  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.64 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.35 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  28.91 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.47 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.9 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  30.56 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  27.1 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  28.08 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.07 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  26.45 
 
 		 371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  28.42 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  28.88 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  25.88 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.73 
 
 		 380 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.99 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.9 
 
 		 390 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  27.4 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  26.18 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.96 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  25.63 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>