161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6613 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 373 aa  747    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.17 
 
 		 366 aa  315  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.98 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  42.62 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.22 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.72 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.13 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.61 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  41.39 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.67 
 
 		 398 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.32 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.22 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  36.14 
 
 		 861 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  36.84 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  36.84 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.53 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  37.57 
 
 		 837 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  36.61 
 
 		 865 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.81 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  38.02 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  36.07 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.42 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.48 
 
 		 371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.91 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.87 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  34.06 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  36.39 
 
 		 850 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.42 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.14 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.16 
 
 		 363 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  37.47 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.32 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  31.32 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.11 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.11 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  31.35 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  27.9 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  27.47 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.05 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  31.59 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.54 
 
 		 366 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  25.61 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  30.51 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  25.87 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  28.33 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  26.32 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.14 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.12 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.12 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.53 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.23 
 
 		 366 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.52 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.68 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.94 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.28 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.41 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  25.37 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  25.4 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  25.37 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.17 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  26.27 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.3 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  24.74 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  25.76 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  25.13 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.38 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.46 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  24.48 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  24.51 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.26 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  25.55 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  25.55 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  26.23 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  29.58 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  25.68 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  27.6 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.84 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  27.32 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  24.86 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  25.16 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  25.97 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.79 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  25.88 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  32.27 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  24.61 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  26.06 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  28.89 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.54 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  26.2 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  25.93 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  25.93 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  25.93 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  25.93 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>