169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5036 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 392 aa  786    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  58.45 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  53.35 
 
 		 372 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  46.81 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.36 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.43 
 
 		 390 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  43.33 
 
 		 364 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  43.33 
 
 		 364 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.84 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.09 
 
 		 373 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.22 
 
 		 374 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.58 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  38.95 
 
 		 837 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  38.94 
 
 		 861 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.54 
 
 		 378 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  38.94 
 
 		 865 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  42.09 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.15 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.33 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  38.33 
 
 		 850 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.12 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.94 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.94 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.78 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  40.48 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.44 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.2 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.31 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  32.23 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  36.19 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  31.96 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.39 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.36 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  34.33 
 
 		 408 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  35.62 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  28.69 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  30.33 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.28 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  29.35 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.22 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.16 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  31.93 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.3 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.4 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  32.79 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.56 
 
 		 399 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  29.75 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.86 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.16 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.52 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.88 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  31.7 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.43 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.11 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  29.15 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  28.49 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  28.49 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  28.49 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.94 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  29.44 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.62 
 
 		 362 aa  133  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.25 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.29 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  29.53 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  28.22 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.9 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.57 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.29 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.27 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.84 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.4 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.66 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  27.42 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  30.11 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.05 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.4 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.75 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  24.4 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  24.8 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.6 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.35 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  25.47 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  32.13 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  24.69 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  26.81 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.71 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  24.69 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  24.69 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  24.69 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  24.69 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  28.76 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  24.69 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  27.35 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  27.07 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  26.46 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>