197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3384 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 371 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.73 
 
 		 409 aa  336  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  57.14 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  48.46 
 
 		 423 aa  329  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.4 
 
 		 357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  50.66 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  46.88 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.41 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.05 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  48.64 
 
 		 382 aa  292  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  48.62 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  43.06 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  43.06 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  44.55 
 
 		 837 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  42.67 
 
 		 370 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  42.05 
 
 		 850 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  42.62 
 
 		 865 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  41.21 
 
 		 861 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.73 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  43.25 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.19 
 
 		 398 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.44 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.24 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.21 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  41.24 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.81 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  41.89 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  41.83 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.86 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.06 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.97 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.67 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.59 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  28.26 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.33 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.54 
 
 		 375 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  29.08 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  28.8 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.54 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.92 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.99 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.89 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.52 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 374 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.39 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.52 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  32.16 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  26.92 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.07 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  32.58 
 
 		 389 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  32.68 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.58 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.47 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  30.06 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.18 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.8 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.2 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  29.83 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.69 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  34.08 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.32 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  29.21 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  34.81 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.79 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  34.49 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  30.2 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  29.38 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.26 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  28.69 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  29.75 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.48 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  25.39 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.41 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.47 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  29.14 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  26.86 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.48 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.89 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.08 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  29.71 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.85 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  29.47 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  28.62 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  24.03 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.09 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  24.03 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  24.03 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  29.12 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.1 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  27.7 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  23.76 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.76 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  23.76 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  24.59 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  23.76 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>