183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2090 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 
362 aa  734    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  85.64 
 
 
360 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  71.79 
 
 
360 aa  528  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  70.83 
 
 
359 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  67.69 
 
 
365 aa  487  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.92 
 
 
366 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  34.09 
 
 
376 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  32.94 
 
 
366 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  33.52 
 
 
365 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.61 
 
 
367 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  32.57 
 
 
385 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  36.41 
 
 
363 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.91 
 
 
366 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.33 
 
 
401 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  34.53 
 
 
399 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  30.81 
 
 
390 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  37.11 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  33.87 
 
 
384 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.65 
 
 
388 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  30.83 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  35.4 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  30 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.7 
 
 
390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.29 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 
389 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.29 
 
 
378 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.02 
 
 
374 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 
376 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 
376 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 
376 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.47 
 
 
375 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.88 
 
 
380 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  30.06 
 
 
376 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  32.69 
 
 
380 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.49 
 
 
375 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.49 
 
 
375 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  35.38 
 
 
380 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  32.69 
 
 
383 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  32.32 
 
 
383 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.5 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.84 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.39 
 
 
390 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.84 
 
 
374 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.94 
 
 
389 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.78 
 
 
375 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.95 
 
 
379 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.01 
 
 
378 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  30.77 
 
 
410 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.26 
 
 
374 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  30 
 
 
388 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.47 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.53 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.15 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  36.43 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.14 
 
 
379 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.98 
 
 
384 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.92 
 
 
379 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  29.14 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  29.14 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  30.58 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  29.14 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  30.58 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  29.14 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.63 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 
372 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  30.86 
 
 
376 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  31.27 
 
 
861 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  31.56 
 
 
865 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  29.66 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.66 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  29.66 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  29.66 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.01 
 
 
380 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  31.41 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  29.31 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  30.83 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  32.76 
 
 
837 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  29.31 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  29.31 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.62 
 
 
366 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.62 
 
 
392 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  28.97 
 
 
372 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.3 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  28.97 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.73 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  30 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  27.56 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.29 
 
 
378 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  30.11 
 
 
423 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.11 
 
 
386 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  32.5 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.63 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.77 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  29.34 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  29.33 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  30.41 
 
 
382 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  31.02 
 
 
370 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>