176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3646 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  100 
 
 
423 aa  856    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  73.04 
 
 
408 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.75 
 
 
409 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.46 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  50 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.7 
 
 
365 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  47.35 
 
 
369 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.89 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.49 
 
 
368 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.37 
 
 
366 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  41.6 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.91 
 
 
378 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  38.1 
 
 
837 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.78 
 
 
378 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  39.11 
 
 
850 aa  199  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  36.39 
 
 
370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  36.69 
 
 
364 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  36.69 
 
 
364 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.61 
 
 
373 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  36.13 
 
 
865 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  36.97 
 
 
365 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.83 
 
 
398 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  35.11 
 
 
861 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.92 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27 
 
 
366 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  34.73 
 
 
386 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.39 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  35.61 
 
 
365 aa  163  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.93 
 
 
392 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.35 
 
 
374 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.42 
 
 
383 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  31.41 
 
 
389 aa  156  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  26.49 
 
 
365 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.77 
 
 
372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.73 
 
 
375 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.68 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  30.53 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.48 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.48 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.63 
 
 
389 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.99 
 
 
385 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  25.35 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  28.96 
 
 
376 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.64 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.87 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.53 
 
 
366 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.06 
 
 
385 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.89 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.62 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.76 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  28.07 
 
 
379 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  25.62 
 
 
390 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  27.52 
 
 
379 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.11 
 
 
362 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.06 
 
 
378 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  26.21 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.36 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.92 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.33 
 
 
372 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.07 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.86 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.43 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.9 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.61 
 
 
375 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.87 
 
 
375 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  26.98 
 
 
383 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  29.16 
 
 
363 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  29.29 
 
 
372 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.5 
 
 
390 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  26.67 
 
 
399 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.23 
 
 
373 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  27.15 
 
 
383 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.21 
 
 
371 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  27.1 
 
 
398 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.15 
 
 
380 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  28.11 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.09 
 
 
381 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  30.29 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.2 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.07 
 
 
390 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  26.93 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  26.78 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  26.78 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  27.38 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  26.78 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  26.78 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  25.62 
 
 
376 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  25.62 
 
 
376 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  26.5 
 
 
371 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  25.62 
 
 
376 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  26.5 
 
 
371 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  28.73 
 
 
377 aa  93.2  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  28.2 
 
 
371 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.21 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.72 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.98 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.62 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  27.84 
 
 
372 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>