180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2510 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 374 aa  732    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  57.6 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  57.6 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  56.23 
 
 		 365 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  54.82 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.65 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  47.11 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.41 
 
 		 398 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.11 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.66 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.7 
 
 		 378 aa  242  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.49 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  44.9 
 
 		 386 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.38 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.33 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.28 
 
 		 385 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.1 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  39.77 
 
 		 865 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  38.33 
 
 		 837 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  38.11 
 
 		 861 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.82 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.14 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.64 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.42 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.51 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  38.12 
 
 		 850 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  35.57 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  34.63 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  38.9 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.93 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.44 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.87 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.8 
 
 		 368 aa  166  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  29 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  31.03 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  30.56 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  32.26 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  34.93 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.83 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.33 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.63 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  26.94 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.71 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.34 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.4 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  27.78 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.33 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.47 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.86 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.55 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.49 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.61 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.18 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.38 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  27.49 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  40.09 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.32 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  31.18 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.45 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.31 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.85 
 
 		 379 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.44 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.14 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.37 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  22.56 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  22.28 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.12 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  31.21 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.44 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.62 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.71 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.1 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.71 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.71 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.95 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  26.9 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  30.7 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  27.75 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.25 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  27.61 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  26.24 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.38 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  27.61 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  30.22 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  26.59 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  30.22 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  27.61 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  27.32 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  30.22 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  26.46 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.74 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  30.22 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>