169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4929 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 365 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  80.99 
 
 		 365 aa  521  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  68.25 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  68.25 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.23 
 
 		 374 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.43 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  49.04 
 
 		 378 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.34 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  47.61 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.85 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.63 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.09 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  44.51 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.13 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.78 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  40.17 
 
 		 837 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  41.24 
 
 		 865 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.78 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  41.01 
 
 		 861 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.67 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.73 
 
 		 383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.36 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.89 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.67 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.49 
 
 		 357 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  41.98 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  37.05 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.58 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  40.27 
 
 		 369 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  42.13 
 
 		 850 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  36.97 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.97 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.18 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.63 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.48 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  34.55 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.02 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  27.67 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.03 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.6 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.54 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  30.27 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  29.51 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  27.81 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  32.56 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.99 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.9 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.4 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.91 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  35.08 
 
 		 363 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  26.67 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.33 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.62 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.07 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.21 
 
 		 365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.46 
 
 		 362 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.76 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  32.36 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.02 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.28 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.81 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.71 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  29.82 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.32 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  30.31 
 
 		 383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.27 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.81 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.26 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  28.93 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  29.66 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.36 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.97 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.48 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.06 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  21.72 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  25.56 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  21.98 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.7 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  28.06 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  28.97 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  27.81 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  30.48 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  30.48 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  30.48 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  28.06 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  31.74 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  30.32 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.4 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  29.24 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.67 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  29.59 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  27.06 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.56 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  27.06 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>