184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2729 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  92.04 
 
 		 378 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 378 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  48.35 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  48.35 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  51.33 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  48.27 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  48.41 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.58 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.73 
 
 		 363 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  42.51 
 
 		 386 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.09 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  46.08 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  40.44 
 
 		 861 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  42.27 
 
 		 865 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  39.67 
 
 		 837 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.4 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.7 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.06 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.33 
 
 		 386 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  35.91 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.9 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.05 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  43.39 
 
 		 369 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.65 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.78 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.97 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.23 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.24 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  35.57 
 
 		 408 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.69 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  39 
 
 		 850 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.36 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  39.46 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  39 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.91 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.53 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.32 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  29.92 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  32.09 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  31.55 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  28.77 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.94 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  29.56 
 
 		 390 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  34.38 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  30.9 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  31.3 
 
 		 389 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.53 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.95 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.14 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  25.95 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  36.09 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.62 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.33 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.16 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.41 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.3 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.47 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.6 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.9 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.27 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.62 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.62 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.46 
 
 		 388 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  26.72 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.86 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.18 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.46 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.13 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.96 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.13 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.29 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.41 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.31 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.99 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  29.48 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  29.01 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.01 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.41 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  29.19 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.97 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  27.15 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.88 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.34 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.04 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  30.16 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.06 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  28.95 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.48 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  27.06 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  28.33 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>