188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4653 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  99.2 
 
 		 375 aa  757    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  93.07 
 
 		 375 aa  713    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 375 aa  761    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  55.56 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.1 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  61.99 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  55.01 
 
 		 374 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  59.95 
 
 		 380 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.1 
 
 		 372 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.63 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.41 
 
 		 377 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.08 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  40.77 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  43.55 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  38.29 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.9 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  40.16 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  36.04 
 
 		 376 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  35.15 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  33.79 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  33.7 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  30.43 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.29 
 
 		 366 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  31.15 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.08 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.88 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  30.87 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  34.2 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  37.5 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  36.07 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  36.74 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  32.43 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.71 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.97 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.05 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.62 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  31.86 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.27 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.81 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.2 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.2 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.2 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  33.22 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  30.52 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.54 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.66 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.22 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.49 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.71 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  31.76 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.3 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.33 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.17 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  30.07 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  34.73 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.9 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.88 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  37.37 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.75 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.74 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.8 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  30.38 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  30.38 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31.43 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  30.82 
 
 		 861 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  29.94 
 
 		 837 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  29.33 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  28.66 
 
 		 865 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.43 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.94 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  31.54 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  29.75 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  28.53 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.84 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  27.86 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.31 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  26.88 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.94 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.55 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.22 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.57 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.85 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  31.03 
 
 		 850 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  31.35 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  26.46 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  26.58 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.54 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  27.38 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  27.38 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  30 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.58 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.08 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  25.92 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  26.65 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  26.79 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  26.79 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>