174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2071 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 
378 aa  734    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.24 
 
 
366 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  39.89 
 
 
363 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  36.01 
 
 
382 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  35.42 
 
 
399 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.33 
 
 
390 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.67 
 
 
378 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.4 
 
 
381 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.26 
 
 
366 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.73 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  35.04 
 
 
376 aa  172  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  36.34 
 
 
389 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.62 
 
 
388 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 
365 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.56 
 
 
366 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 
382 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.26 
 
 
382 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  30.9 
 
 
367 aa  169  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 
380 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.14 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  32.53 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.62 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  31.83 
 
 
380 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  32.76 
 
 
376 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  32.76 
 
 
376 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  32.76 
 
 
376 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.03 
 
 
379 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.08 
 
 
384 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 
390 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  31.53 
 
 
376 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  34.05 
 
 
376 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  32.65 
 
 
371 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 
376 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  31.86 
 
 
379 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  30.98 
 
 
383 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  31.87 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  35.21 
 
 
861 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  31.86 
 
 
379 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  34.28 
 
 
383 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  29.34 
 
 
387 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  33.91 
 
 
384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.36 
 
 
379 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 
380 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  29.67 
 
 
376 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.36 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  32.85 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  25.5 
 
 
383 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  29.82 
 
 
384 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  34.73 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  32.42 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  32.46 
 
 
377 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  35.84 
 
 
865 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.36 
 
 
379 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  32.56 
 
 
377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  31.25 
 
 
371 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  30.12 
 
 
374 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  29.72 
 
 
374 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  27.1 
 
 
381 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.01 
 
 
388 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  31.1 
 
 
371 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  35.71 
 
 
364 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  35.71 
 
 
364 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.33 
 
 
389 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.81 
 
 
374 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.92 
 
 
360 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  32.3 
 
 
398 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  24.72 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.7 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  30.12 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.47 
 
 
378 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.21 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  25.98 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  25.98 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  33.43 
 
 
837 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.81 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  28.03 
 
 
373 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  25.7 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.7 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  25.7 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  34 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  25.7 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  27.9 
 
 
379 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  28.48 
 
 
373 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.78 
 
 
362 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  26.63 
 
 
372 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  25.42 
 
 
372 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 
373 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  29.14 
 
 
380 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  29.48 
 
 
371 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  28.21 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  28.21 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>