181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0693 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 382 aa  777    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  79.84 
 
 		 382 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  65.61 
 
 		 401 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  56.05 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.88 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.88 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.77 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  47.37 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  46.05 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  46.77 
 
 		 376 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  46.77 
 
 		 376 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  46.77 
 
 		 376 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.89 
 
 		 388 aa  352  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  46.51 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.09 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  47.04 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  47.34 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  45.97 
 
 		 380 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  44.85 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.43 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  46.28 
 
 		 376 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.09 
 
 		 382 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.18 
 
 		 379 aa  325  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.72 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.47 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  45.73 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  37.99 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  38.4 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  37.14 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  35.87 
 
 		 385 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.79 
 
 		 366 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  37.76 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  34.52 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  35.48 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  33.87 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  36.86 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  34.92 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.25 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  36.07 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  38.81 
 
 		 363 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  34.93 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  36.32 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  34.12 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  34.12 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.12 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  34.12 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  34.12 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  34.12 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  33.83 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  33.7 
 
 		 371 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  33.83 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  32.26 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  32.26 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  32.26 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  32.26 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  32.39 
 
 		 372 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  31.55 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  33.54 
 
 		 327 aa  193  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  35.15 
 
 		 384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  33.42 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.43 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.26 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.63 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.43 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  32.79 
 
 		 379 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  34.26 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 415 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  31.76 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.7 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  31.62 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.12 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  30.4 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.71 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  33.93 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  30.41 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.06 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.89 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  29.47 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  33.13 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  30.68 
 
 		 376 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  29.21 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  30.21 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  32.83 
 
 		 377 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  30.87 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.99 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>