200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2615 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 379 aa  790    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  94.72 
 
 		 379 aa  755    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  75.47 
 
 		 390 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  64.38 
 
 		 385 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  58.01 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  56.91 
 
 		 365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  54.83 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  53.19 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  44.93 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  42.65 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  43.11 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  41.67 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.16 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  39.51 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  38.48 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.34 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.71 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.57 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  38.8 
 
 		 382 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  35.92 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.49 
 
 		 374 aa  233  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.76 
 
 		 374 aa  232  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.52 
 
 		 390 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.49 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.56 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  39.45 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.77 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.15 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.15 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.88 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  35.29 
 
 		 376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.82 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.86 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.34 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  34.9 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.52 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  34.44 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.98 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.7 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.51 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  33.15 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  33.15 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  33.15 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  32.89 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  33.88 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.69 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  32.77 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.77 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  32.98 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  33.06 
 
 		 865 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 379 aa  196  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  32.1 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  34.21 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  34.21 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.77 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  34.21 
 
 		 372 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 837 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  34.21 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  32.59 
 
 		 861 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  32.1 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  33.92 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.53 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.98 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  35.12 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.12 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  35.12 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  35.12 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  35.12 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  35.12 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  32.49 
 
 		 365 aa  186  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  32.87 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  35.12 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  35.69 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  34.78 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.48 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  33.14 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  34.78 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.23 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.45 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  31.59 
 
 		 370 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.81 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  33.43 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  31.4 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.89 
 
 		 378 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  34.01 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  34.15 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  30.53 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  32.25 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.55 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.69 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  30.49 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  30.28 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>