216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3891 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 372 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  66.4 
 
 		 374 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  66.13 
 
 		 374 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  65.59 
 
 		 374 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  64.13 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.1 
 
 		 375 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.1 
 
 		 375 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  61.48 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  53.83 
 
 		 375 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.63 
 
 		 389 aa  335  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.36 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  45.14 
 
 		 389 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  43.44 
 
 		 410 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.73 
 
 		 377 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  44.05 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  45.13 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  41.37 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  43.87 
 
 		 375 aa  261  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.55 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  37.82 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  37.25 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  35.33 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  34.93 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  31.79 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  32.51 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.81 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  37.83 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  38.9 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.57 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  38.36 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.81 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.69 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  39.12 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  39.94 
 
 		 378 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.77 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  33.52 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.62 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  33.81 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  32.88 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.39 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.96 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.97 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.97 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  35.17 
 
 		 865 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.97 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.62 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.29 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  36.33 
 
 		 861 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  34.41 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 380 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.69 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  35.44 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  35.4 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  32.66 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  35.16 
 
 		 837 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.88 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.81 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  32.89 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.53 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.92 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.86 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  33.16 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.06 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.45 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  35.63 
 
 		 850 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.1 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  30.59 
 
 		 380 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.06 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.82 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  31.68 
 
 		 423 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  34.67 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.94 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.71 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.1 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  33.67 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  33.67 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.07 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.58 
 
 		 386 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.94 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  33.23 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.45 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.77 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.65 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  32.81 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  26.48 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  34.42 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.07 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.71 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  27.06 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  26.05 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.46 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  27.46 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.53 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.67 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  26.16 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.08 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  25.23 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>