195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3020 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 409 aa  818    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  48.75 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  49.72 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.73 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.82 
 
 		 386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  47.54 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.3 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  50 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  50.4 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.15 
 
 		 366 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  41.86 
 
 		 837 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  42.7 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  41.62 
 
 		 861 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.44 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  41.14 
 
 		 850 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.4 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  40.4 
 
 		 865 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.7 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  37.09 
 
 		 364 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  37.09 
 
 		 364 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  39.12 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.12 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.38 
 
 		 373 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.52 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  37.2 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.81 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.06 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  38.7 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.82 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.47 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.47 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  37.57 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  30.64 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.37 
 
 		 383 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.28 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.11 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.93 
 
 		 374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  29.43 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  28.89 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  30.36 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.72 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.44 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.51 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  28.93 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.71 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.84 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  29.49 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  29.4 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.65 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.73 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  28.73 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.06 
 
 		 388 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.53 
 
 		 375 aa  136  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.42 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.45 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.36 
 
 		 378 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.91 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  30.22 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.51 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.5 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.35 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  32.43 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.4 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.65 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  30.79 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  30.79 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  30.79 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.93 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.22 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  29.82 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.3 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  25.21 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  32.01 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  33.68 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  30.54 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  28.95 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.76 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.08 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.32 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  26.63 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  34.46 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.77 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.73 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.09 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  27.81 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  30.25 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  30.51 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  26.21 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.86 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  27.52 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  31.81 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  30.36 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  25.87 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.27 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.08 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  29.32 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  26.11 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  28.76 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  29.29 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>