165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1896 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 357 aa  694    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.4 
 
 		 371 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  55.31 
 
 		 368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  50 
 
 		 409 aa  291  9e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  51.37 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  46.89 
 
 		 423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  46.48 
 
 		 408 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.54 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  51.75 
 
 		 369 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.65 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  44.22 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  43.62 
 
 		 850 aa  208  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  42.31 
 
 		 861 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  42.26 
 
 		 865 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.69 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  39.58 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  39.58 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.07 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  38.76 
 
 		 837 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  43.84 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.4 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.72 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.25 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.47 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.39 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  39.3 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.48 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  38.24 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  39.04 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.88 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.54 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.06 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.5 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.51 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.24 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.48 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.06 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.61 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.85 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.29 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.99 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.52 
 
 		 372 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.07 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  25.29 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  31.7 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.19 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.54 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  31.58 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  25.58 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  25.7 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.12 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.62 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.89 
 
 		 390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  27.44 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.95 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  27.12 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.59 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  26.4 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.36 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.17 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  24.64 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.31 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  27.44 
 
 		 410 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.93 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.65 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  29.88 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.18 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  30.38 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  28.9 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  27.09 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  27 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.65 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  32.22 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.62 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.66 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.86 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  30.09 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  29.62 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.37 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  28.98 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  29.77 
 
 		 380 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.27 
 
 		 388 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  28.37 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.62 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.38 
 
 		 380 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.86 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.49 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.11 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  28.81 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  26.32 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  26.1 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  31.35 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>