169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3862 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 408 aa  825    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  73.04 
 
 		 423 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.72 
 
 		 409 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  50.41 
 
 		 386 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.88 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.7 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.48 
 
 		 357 aa  272  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  46.09 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.54 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.96 
 
 		 366 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  39.67 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.29 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  35.08 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  37.33 
 
 		 837 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  35.08 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  38.36 
 
 		 850 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  35.62 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.63 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.57 
 
 		 378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  36.74 
 
 		 861 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  36.84 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  34.26 
 
 		 865 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.28 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.67 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.33 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.4 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.21 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.63 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  34.66 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  35.73 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.21 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.06 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.1 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  26.67 
 
 		 365 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  28.75 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.22 
 
 		 366 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.83 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.34 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.34 
 
 		 374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.26 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  30.65 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.61 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.62 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.6 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  29.61 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  27.76 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  31.15 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.56 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.43 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  28.77 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  26.34 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.53 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  25.96 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  25.34 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.65 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.27 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.52 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.22 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.89 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.64 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.21 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.52 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  29.36 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  26.87 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  27.01 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.2 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.12 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.07 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  27.25 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  27.42 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.08 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  26.89 
 
 		 372 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.59 
 
 		 382 aa  96.3  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  27.42 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  26.06 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  26.28 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  27.8 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  30.32 
 
 		 373 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.82 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.54 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.2 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.97 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.41 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  29.09 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.67 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.08 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  25.45 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  27.88 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  25.55 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.51 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  26.94 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  25.3 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  25.3 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>