170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2802 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 372 aa  734    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  60.62 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  53.35 
 
 		 392 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.94 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  44.75 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.62 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  42.06 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  42.06 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.78 
 
 		 374 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  41.01 
 
 		 837 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.84 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.35 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.92 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.65 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  39.89 
 
 		 865 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  37.74 
 
 		 861 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  42.6 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.74 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  42.36 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.89 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.95 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.98 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.8 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  34.63 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  36.39 
 
 		 850 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  38.18 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  36.24 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.71 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  32.77 
 
 		 423 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.87 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.49 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.43 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.25 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.28 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  29.44 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.47 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.26 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  30.08 
 
 		 379 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  33.42 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.81 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.92 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.89 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.24 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.29 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  30.64 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.22 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.3 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.48 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.82 
 
 		 385 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.06 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.36 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  32.12 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  29.92 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.03 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.07 
 
 		 379 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.2 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.73 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  30.68 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.73 
 
 		 375 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.22 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  29.67 
 
 		 375 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.94 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.59 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.94 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.24 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.24 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  29.75 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.73 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.48 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.35 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.97 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.79 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  29.3 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  30.7 
 
 		 365 aa  133  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  33.59 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  30.49 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  32.43 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.93 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.53 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.53 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  29.53 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.37 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  28.09 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.09 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  28.09 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.04 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  27.81 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  29.58 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  27.9 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.99 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  27.81 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.33 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.41 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  26.89 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>