216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4527 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 374 aa  751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  94.12 
 
 		 374 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  94.12 
 
 		 374 aa  710    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  66.4 
 
 		 372 aa  494  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  63.34 
 
 		 380 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  55.83 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.1 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.37 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  58.87 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.76 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.81 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  42.78 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  44.2 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.54 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  40.91 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  41.92 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  40.92 
 
 		 378 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  40.81 
 
 		 375 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  36.49 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  36.49 
 
 		 379 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  34.42 
 
 		 365 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.32 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  34.96 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  34.59 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  39.52 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  34.15 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  33.14 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  39.51 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  38.69 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.14 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  35.11 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.51 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.64 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  34.52 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  34.45 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  34.43 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  34.43 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  34.43 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  41.14 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  37.03 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  34.42 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.95 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  38.83 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.88 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.69 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.96 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.45 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.23 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.96 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  32.49 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  34.15 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  32.88 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  34.86 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  34.77 
 
 		 861 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.43 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.14 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.93 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  34.77 
 
 		 865 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  34.21 
 
 		 837 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  32.98 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.02 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.51 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  33.53 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.56 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  31.56 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.52 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  31.56 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  36.86 
 
 		 850 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  32.76 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.9 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  32.73 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  30.43 
 
 		 365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.16 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.14 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  31.68 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.12 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  31.79 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  30.64 
 
 		 423 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  29.68 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  32.01 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.96 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.1 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.76 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  31.43 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.89 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.4 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.28 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.07 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  30.54 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.29 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  31.61 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  28.75 
 
 		 373 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  27.01 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  26.58 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.68 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>