176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1633 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 376 aa  761    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  58.33 
 
 		 375 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  55.5 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  50.13 
 
 		 389 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  42.82 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  40.65 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  43.11 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.05 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  38.89 
 
 		 390 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.44 
 
 		 374 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.24 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.91 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.18 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  40.18 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  35.95 
 
 		 366 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  37.32 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.53 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.7 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.51 
 
 		 375 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.27 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.04 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.77 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  37.76 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.99 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.02 
 
 		 378 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.39 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  32.97 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.03 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.16 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  35.64 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  34 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  34.07 
 
 		 368 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  35.03 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.32 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  40.78 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.51 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.58 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  32.97 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.53 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  33.63 
 
 		 865 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  33.24 
 
 		 861 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.43 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  34.29 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  35.07 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  37.29 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.53 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  32.56 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  35.92 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  35.67 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  31.95 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.47 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  32.09 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  31.95 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  31.45 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.4 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  32.09 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  32.09 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  32.94 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  35.84 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  32.09 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  35.84 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  35.84 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  35.67 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  31.66 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.66 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  31.66 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  30.86 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  31.66 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  31.36 
 
 		 372 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  32 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31.14 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  34.12 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  32.61 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  34.39 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  34.39 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.21 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.79 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  29.71 
 
 		 374 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  35.61 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  29.65 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.34 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  29.38 
 
 		 381 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  30.26 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  30.26 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  33.62 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  30.3 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  35.17 
 
 		 850 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.88 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.06 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  28.16 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  29.31 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  31.14 
 
 		 837 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  33.52 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  31.41 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>