185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3956 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 390 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  73.9 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  69.62 
 
 		 388 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  67.92 
 
 		 390 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  58.99 
 
 		 401 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  54.88 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  54.5 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  46.72 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  46.19 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  47.61 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.33 
 
 		 379 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.6 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.95 
 
 		 380 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  45.36 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  46.49 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.09 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  45.68 
 
 		 376 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  45.82 
 
 		 376 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  45.82 
 
 		 376 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  45.82 
 
 		 376 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  44.59 
 
 		 380 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.17 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.95 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.09 
 
 		 379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  45.65 
 
 		 376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  43 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  38.34 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  36.99 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  37.43 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  39.39 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  36.16 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  33.61 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.51 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  34.65 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  35.62 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  32.5 
 
 		 367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  38.44 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  34.35 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.37 
 
 		 366 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  34.87 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 		 376 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  32.49 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  33.7 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  32.43 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.54 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  31.86 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  36.26 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  35.5 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  32.15 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  32.15 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.15 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  30.96 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  30.68 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  32.15 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  32.15 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  34 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  35.44 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  33.61 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  33.88 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  35.16 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  33.15 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  33.73 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  33.83 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  33.98 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  32.1 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  32.35 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 374 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  35.58 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  33.64 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.05 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.78 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.69 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.51 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  32.18 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  31.73 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  32.34 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  33.24 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 371 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 		 371 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  31.51 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  32.54 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  32.54 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  32.54 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  32.54 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  32.54 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  34.89 
 
 		 850 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>