176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3702 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  100 
 
 
376 aa  761    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  65.05 
 
 
379 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  65.41 
 
 
376 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  65.41 
 
 
376 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  65.41 
 
 
376 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  64.59 
 
 
376 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  64.05 
 
 
380 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  62.97 
 
 
380 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  65.06 
 
 
379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  59.57 
 
 
383 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  58.71 
 
 
382 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  55 
 
 
383 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  54.47 
 
 
383 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.84 
 
 
388 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.28 
 
 
379 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  54.93 
 
 
380 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.91 
 
 
384 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.55 
 
 
380 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.87 
 
 
401 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  46.28 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  46.01 
 
 
382 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  47.11 
 
 
398 aa  322  8e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  44.3 
 
 
399 aa  310  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.19 
 
 
388 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.65 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.86 
 
 
390 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  35.29 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  34.79 
 
 
385 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  34.5 
 
 
379 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  34.07 
 
 
390 aa  212  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  33.42 
 
 
365 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  35.66 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  34.91 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.34 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.96 
 
 
366 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  35.26 
 
 
378 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  32.23 
 
 
367 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  34.78 
 
 
375 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  30.89 
 
 
373 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  33.05 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.42 
 
 
366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  36.13 
 
 
389 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  30.08 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.08 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  30.08 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  30.08 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  32.02 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  30.08 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  31 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  30.08 
 
 
372 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  29.89 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  30.08 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 
371 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 
371 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 
371 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 
371 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 
371 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  35.07 
 
 
376 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 
371 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.41 
 
 
374 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  30.46 
 
 
415 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.41 
 
 
374 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  30.19 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  31.42 
 
 
371 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  30.25 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.86 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  29.73 
 
 
372 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  29.73 
 
 
372 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  30.91 
 
 
374 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  29.73 
 
 
372 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  30.91 
 
 
374 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  29.46 
 
 
372 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  30.91 
 
 
374 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  29.73 
 
 
372 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  31 
 
 
327 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  30.77 
 
 
371 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  30.47 
 
 
374 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  29.37 
 
 
373 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  29.44 
 
 
379 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  29.37 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  29.91 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  35.25 
 
 
363 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  35.23 
 
 
837 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  25.45 
 
 
383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  30.79 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  25.37 
 
 
383 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  35.15 
 
 
377 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  30.21 
 
 
377 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  34.7 
 
 
861 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  29.61 
 
 
381 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  34.73 
 
 
377 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  34.7 
 
 
865 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.78 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.66 
 
 
372 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>