199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4831 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  100 
 
 
385 aa  800    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  67.82 
 
 
390 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  64.38 
 
 
379 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  64.64 
 
 
379 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.91 
 
 
366 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  54.42 
 
 
365 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  53.12 
 
 
366 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  54.57 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  40.74 
 
 
389 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  38.54 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  40.65 
 
 
376 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  40.27 
 
 
375 aa  275  8e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.8 
 
 
401 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.15 
 
 
366 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  38.8 
 
 
376 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  36.44 
 
 
399 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.99 
 
 
390 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  35.98 
 
 
382 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  35.97 
 
 
382 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.52 
 
 
390 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.26 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.93 
 
 
379 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.96 
 
 
384 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.56 
 
 
389 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 
388 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  33.98 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.59 
 
 
374 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  34.79 
 
 
376 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.93 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.14 
 
 
374 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.86 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  35.04 
 
 
363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 
376 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 
376 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 
376 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31.44 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.88 
 
 
382 aa  212  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.58 
 
 
383 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 
380 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 
383 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  32.54 
 
 
380 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.87 
 
 
380 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.1 
 
 
388 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.69 
 
 
380 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.54 
 
 
379 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.42 
 
 
375 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  31.94 
 
 
865 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.87 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.44 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.16 
 
 
381 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.6 
 
 
375 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.55 
 
 
379 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.61 
 
 
380 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  32.49 
 
 
373 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  28.9 
 
 
383 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  32.86 
 
 
372 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  32.86 
 
 
372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  32.86 
 
 
372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  32.86 
 
 
372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  30.47 
 
 
861 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.21 
 
 
365 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 
383 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  32.05 
 
 
370 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  32.58 
 
 
372 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.33 
 
 
377 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.57 
 
 
362 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 
360 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  30.11 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.51 
 
 
378 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.12 
 
 
360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  30 
 
 
837 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  30.11 
 
 
372 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  30.37 
 
 
372 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  29.83 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.83 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  29.83 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  29.83 
 
 
372 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  33.24 
 
 
398 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  32.11 
 
 
359 aa  180  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 
372 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 
376 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  29.53 
 
 
371 aa  176  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  31.12 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.74 
 
 
377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  32.08 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.5 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.78 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.75 
 
 
378 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.92 
 
 
378 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  30.57 
 
 
371 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  30.57 
 
 
371 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  29.39 
 
 
370 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  30.57 
 
 
371 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  30.2 
 
 
371 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  30.29 
 
 
371 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  30.29 
 
 
371 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  30.26 
 
 
371 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  30.29 
 
 
371 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  30.26 
 
 
371 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>