178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2274 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 
382 aa  755    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  39.89 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.97 
 
 
366 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.8 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  39.38 
 
 
363 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.68 
 
 
379 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  34.81 
 
 
379 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  35.29 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  35.06 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  30.5 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  32.96 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.23 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  35.01 
 
 
380 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  34.72 
 
 
380 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  32.25 
 
 
365 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.86 
 
 
366 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.8 
 
 
390 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.16 
 
 
390 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  34.01 
 
 
378 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  34.42 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  34.42 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  34.42 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  31.04 
 
 
390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.1 
 
 
375 aa  163  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  30.52 
 
 
366 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  35.26 
 
 
398 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  35.41 
 
 
359 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.81 
 
 
375 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  30.81 
 
 
380 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.9 
 
 
379 aa  159  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.51 
 
 
375 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.41 
 
 
388 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  35.92 
 
 
360 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31.02 
 
 
383 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.97 
 
 
382 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.6 
 
 
383 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32 
 
 
379 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  34.52 
 
 
376 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.62 
 
 
388 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.66 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  33.62 
 
 
383 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  34.48 
 
 
376 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.26 
 
 
378 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  31.93 
 
 
399 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  31.69 
 
 
389 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.69 
 
 
363 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  34.87 
 
 
365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  34.97 
 
 
370 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  30.17 
 
 
387 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.81 
 
 
376 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 
374 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 
374 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  30.91 
 
 
374 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.19 
 
 
360 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  29.34 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.34 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  29.34 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.53 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  29.34 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  29.63 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  29.34 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  30.38 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  29.34 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  30.84 
 
 
379 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 
371 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.51 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  28.9 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  28.9 
 
 
372 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  29.34 
 
 
372 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  29.46 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.46 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 
372 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 
372 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  30.68 
 
 
374 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  30.56 
 
 
371 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  31.12 
 
 
374 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 
372 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.97 
 
 
377 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  29.17 
 
 
371 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  29.17 
 
 
371 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 
410 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  29.33 
 
 
376 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  29.17 
 
 
371 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  29.17 
 
 
371 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  29.17 
 
 
371 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  29.17 
 
 
371 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.7 
 
 
380 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  31.25 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.68 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  32.36 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 
371 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.31 
 
 
378 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  28.78 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>