190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0633 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 379 aa  784    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  76.86 
 
 		 380 aa  611  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  70.93 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  67.37 
 
 		 382 aa  547  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  63.42 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  58.99 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  59.52 
 
 		 383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.99 
 
 		 380 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  55.95 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  54.32 
 
 		 380 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  54.5 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  54.57 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  54.57 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  54.57 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  54.03 
 
 		 380 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  53.03 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  52.28 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.11 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.93 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  47.09 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  46.58 
 
 		 382 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  45.09 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.33 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.31 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  45.86 
 
 		 398 aa  325  7e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.97 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  34.93 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  32.97 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  32.15 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  35.83 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  32.52 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.15 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.87 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  32.43 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  33.95 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  33.51 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.36 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  30.34 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  30.08 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.96 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  32.47 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  28.42 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  28.42 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  30.87 
 
 		 387 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  28.3 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  28.16 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  29.57 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  28.92 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  27.89 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  28.92 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.92 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  28.92 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  28.92 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.15 
 
 		 375 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  30.23 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  30.95 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  30.46 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  29.4 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  27.64 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  27.64 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  30.37 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.81 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  27.64 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  32.58 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  32.58 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.88 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  30.25 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.96 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.34 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  32.15 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  30.17 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  31.69 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  29.02 
 
 		 376 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  28.88 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  29.73 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  31.92 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.9 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  28.2 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.68 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  27.17 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  27.17 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  27.17 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  27.17 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  27.17 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  27.25 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  28.2 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>