180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3336 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 371 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  87.06 
 
 		 372 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  73.24 
 
 		 377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  73.71 
 
 		 377 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  72.9 
 
 		 377 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  65.58 
 
 		 371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  65.58 
 
 		 371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  65.58 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  65.58 
 
 		 371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  65.58 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  65.58 
 
 		 371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  65.85 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  65.31 
 
 		 371 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  63.34 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  63.61 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  63.34 
 
 		 371 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  58.81 
 
 		 381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  58.27 
 
 		 379 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  59.08 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  58.54 
 
 		 374 aa  461  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  59.08 
 
 		 374 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  57.68 
 
 		 374 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  57.72 
 
 		 374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  57.72 
 
 		 374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  57.45 
 
 		 376 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  55.83 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  57.1 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  53.24 
 
 		 373 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  52.42 
 
 		 373 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  52.59 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  45.55 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  45.55 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  45.28 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  45.68 
 
 		 373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  45.28 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  45.28 
 
 		 372 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  44.74 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.74 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  44.74 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  44.74 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  44.74 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  44.74 
 
 		 372 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  44.47 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  44.47 
 
 		 372 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  47.55 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  47.83 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  42.05 
 
 		 383 aa  325  8.000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  41.78 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.45 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  35.71 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.4 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  33.7 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.98 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  32.54 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.14 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.33 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.56 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  32.38 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.89 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.97 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  30.05 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.89 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  29.55 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.4 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  29.73 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  30.77 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.24 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  31.25 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  29.08 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  28.18 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  28.18 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  28.18 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  30.52 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  27.99 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  30.24 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.35 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  30.61 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  28.73 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.58 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.29 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.6 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  31.65 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  29.31 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  28.01 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  27.75 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  29.33 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  27.84 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  28.41 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.65 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.47 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.06 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>