197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7205 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 410 aa  839    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.51 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.44 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.78 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.03 
 
 		 375 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.96 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.96 
 
 		 374 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.93 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.77 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.77 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.43 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.17 
 
 		 378 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  41.26 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  40.11 
 
 		 378 aa  243  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.93 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.75 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  39.5 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  37.76 
 
 		 376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  34.9 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  34.35 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.93 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.04 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.87 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  31.18 
 
 		 365 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  31.44 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  32.29 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.42 
 
 		 366 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  31.74 
 
 		 380 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  36.58 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  33.92 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  31.59 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  34.44 
 
 		 373 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  33.82 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.97 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.01 
 
 		 382 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.79 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  37.85 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  28.98 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.59 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  28.69 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  28.41 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  28.41 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  30 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  28.41 
 
 		 376 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.91 
 
 		 379 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  30.48 
 
 		 861 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  28.81 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  27.59 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.81 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.97 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  29.3 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.25 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  26.55 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.53 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  29.46 
 
 		 865 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  31.37 
 
 		 850 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  28.95 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.32 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  30.37 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  30.27 
 
 		 837 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.01 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  29.95 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.09 
 
 		 378 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.54 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.11 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  30.64 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.24 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  31.91 
 
 		 370 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.34 
 
 		 383 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.01 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.02 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.13 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  26.45 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.7 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  30.51 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  27.84 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  27.84 
 
 		 371 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.29 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  30.46 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  27.08 
 
 		 371 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  27.27 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  31.62 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  26.4 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  26.75 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  29.61 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.68 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  27.05 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  27.05 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  27.05 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  27.05 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>