171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4754 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  100 
 
 
364 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  100 
 
 
364 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  68.25 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  65.56 
 
 
365 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  57.6 
 
 
374 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.53 
 
 
373 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  50.14 
 
 
378 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.35 
 
 
378 aa  286  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  47.14 
 
 
370 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.81 
 
 
363 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.33 
 
 
392 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.51 
 
 
398 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  45.71 
 
 
386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.06 
 
 
371 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  39.01 
 
 
837 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.06 
 
 
372 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.73 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.84 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  40.9 
 
 
865 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.67 
 
 
390 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  41.42 
 
 
369 aa  215  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.16 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  37.82 
 
 
861 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.09 
 
 
409 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  40.75 
 
 
382 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  38.83 
 
 
850 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.24 
 
 
366 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  36.69 
 
 
423 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.13 
 
 
368 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.45 
 
 
383 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  35.08 
 
 
408 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.58 
 
 
357 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.98 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 
366 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.08 
 
 
366 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.72 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  28.22 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 
376 aa  172  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  34.39 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  31.52 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  31.25 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  32.73 
 
 
378 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.96 
 
 
363 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  27.47 
 
 
365 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.98 
 
 
385 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 
375 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.82 
 
 
375 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.84 
 
 
373 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.73 
 
 
388 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.33 
 
 
399 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.22 
 
 
366 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.56 
 
 
374 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.19 
 
 
379 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.38 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.12 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.11 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.85 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  25.96 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  30.26 
 
 
383 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.75 
 
 
379 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.53 
 
 
383 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.58 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.62 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  32.52 
 
 
383 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.89 
 
 
376 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.89 
 
 
376 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.89 
 
 
376 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  31.38 
 
 
360 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.67 
 
 
372 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  32.06 
 
 
389 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  31.02 
 
 
380 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.53 
 
 
378 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  22.76 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.63 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.48 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  21.95 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  32.07 
 
 
376 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.41 
 
 
380 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.96 
 
 
389 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  31.6 
 
 
359 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.46 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  31 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.44 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.32 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  27.12 
 
 
379 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  27.98 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  28.53 
 
 
384 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  27.47 
 
 
381 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.66 
 
 
388 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.86 
 
 
378 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.54 
 
 
390 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  27.55 
 
 
372 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  26.65 
 
 
374 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 
373 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  24.59 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.95 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  26.11 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  26.99 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>