167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1816 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 365 aa  730    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  80.99 
 
 		 365 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  65.56 
 
 		 364 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  65.56 
 
 		 364 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  53.61 
 
 		 374 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.4 
 
 		 363 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  48 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  46.41 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.13 
 
 		 378 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  46.13 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.82 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  44.51 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.11 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.78 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.52 
 
 		 372 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.23 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  40.96 
 
 		 837 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.44 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  42.9 
 
 		 865 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.84 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  40.67 
 
 		 861 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  42.78 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.96 
 
 		 386 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.57 
 
 		 409 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.71 
 
 		 365 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  40.75 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  40.06 
 
 		 850 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.49 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.22 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  35.85 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  34.82 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.17 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.44 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.35 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.41 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  34.17 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.82 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  30.77 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  30.77 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.67 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  27.91 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.86 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.47 
 
 		 373 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.48 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  31.73 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.14 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.49 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  31.12 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.2 
 
 		 378 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  34.44 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.7 
 
 		 379 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.33 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.64 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.64 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.64 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.67 
 
 		 374 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.53 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.42 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.24 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.14 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.95 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.91 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.21 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.92 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.64 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.69 
 
 		 382 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.65 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.05 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.05 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.89 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  28.44 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  21.82 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.43 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  28.41 
 
 		 359 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  32 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.43 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.32 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  25.35 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  28.21 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.36 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  21.15 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.03 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.4 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  27.12 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.63 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.08 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.86 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.78 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.88 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  26.4 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  27.01 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  25.71 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.46 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  29.18 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>