181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0270 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 366 aa  731    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  50 
 
 		 386 aa  325  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.39 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  51.37 
 
 		 357 aa  311  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.46 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.15 
 
 		 409 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  46.37 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  45.96 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.11 
 
 		 365 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  46.8 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.45 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  42.7 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.9 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  40.34 
 
 		 837 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  41 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  39.04 
 
 		 861 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.5 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.48 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  39.24 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  39.24 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  40.06 
 
 		 865 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  39 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.18 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.77 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  38.38 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  37.16 
 
 		 850 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.16 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  40 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.86 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.96 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  39.18 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  35.49 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  29.86 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.05 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.93 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  36.44 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.37 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  32.96 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.02 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.25 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  31.65 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  33.14 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.81 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  32.29 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.94 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.79 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  33.56 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.4 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  29.8 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.88 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  30.92 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.18 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.5 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.37 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.07 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  25.48 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.56 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.66 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.79 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.5 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.92 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 		 368 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.78 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  30.51 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.22 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  33.81 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.26 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.58 
 
 		 375 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.12 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.86 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.27 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.23 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  33.99 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  28.93 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  28.11 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.08 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.39 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  27.09 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.79 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  28.13 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  28.12 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  34.31 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  27.38 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  28.33 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  28.49 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  28.49 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  28.49 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  27.7 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  28.12 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  28.8 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  28.67 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  28.67 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  26.6 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  26.6 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  28.67 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>