172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3494 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 398 aa  801    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  51.33 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.36 
 
 		 392 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  46.87 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  49.32 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  44.97 
 
 		 386 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  44.51 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  44.51 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.86 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.15 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.41 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  39.83 
 
 		 861 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.26 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  44.99 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.33 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  41.83 
 
 		 865 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.44 
 
 		 409 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  39.01 
 
 		 837 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  42.82 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.11 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  41.67 
 
 		 850 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.35 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.19 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.35 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.29 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.84 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  39.94 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  35.15 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  35.83 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.67 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.16 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.27 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.48 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.06 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  39.27 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.25 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.78 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.01 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  30.96 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  27.78 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  26.1 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  25.76 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  29.28 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.53 
 
 		 389 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.62 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.61 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  25.76 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  26.76 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.21 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  25.56 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  26.78 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  30.89 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.75 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.04 
 
 		 375 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.04 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.75 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.16 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.45 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.9 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.43 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.74 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  27.01 
 
 		 399 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.01 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.03 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.88 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.3 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.27 
 
 		 374 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.27 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.99 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.96 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.08 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.18 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.53 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  22.53 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.42 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  32.23 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  26.65 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  24.09 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  28.71 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  26.82 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  26.22 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  27.38 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  31.33 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  27.37 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  33.09 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  25.5 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.41 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.22 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  27.78 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  26.78 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  29.17 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.65 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.4 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  23.99 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  27.59 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>