171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0126 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 365 aa  733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.3 
 
 		 409 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.41 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.32 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  44.1 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  43.7 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  48.46 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.74 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.94 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.78 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  44.32 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  41.8 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  39.84 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  39.84 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  39.34 
 
 		 861 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.44 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  39.06 
 
 		 837 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.33 
 
 		 392 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.7 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  39.12 
 
 		 865 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.98 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.06 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.13 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  40.17 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  39.94 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.15 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  36.91 
 
 		 850 aa  192  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  36.99 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.59 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.51 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.43 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.88 
 
 		 372 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  32.11 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  32.73 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  32.39 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.14 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.43 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.43 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.35 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.47 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.55 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.28 
 
 		 372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.57 
 
 		 390 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.58 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.67 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.84 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.43 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  29.95 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.61 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  27.84 
 
 		 367 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  28.66 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.25 
 
 		 375 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.7 
 
 		 375 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.58 
 
 		 410 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.02 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.84 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.86 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  31.59 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  30.19 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  32 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  30.88 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.95 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.98 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.69 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.14 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.82 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.65 
 
 		 362 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 		 365 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.02 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  30.77 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.2 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.81 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  30.94 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.36 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.07 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  27.62 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.08 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.81 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  30.55 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  28.17 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.81 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.73 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  30.29 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  28.85 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  27.19 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.01 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  29.12 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  29.15 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  27.95 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  33.11 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  33.73 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  27.83 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  27.42 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>