175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1127 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  774    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.59 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  35.23 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.52 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.51 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.77 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.17 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  34.14 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  34.89 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  33.62 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.06 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.39 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  32.57 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.2 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.78 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.17 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.61 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.56 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  34.47 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  33.83 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  30.54 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.5 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  28.65 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  31.35 
 
 		 390 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  33.22 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  33.22 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.67 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  33.22 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.35 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.94 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.17 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  32.96 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  32.24 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  34.11 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  30.96 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  34.48 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.49 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.04 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  29.87 
 
 		 374 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.43 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.02 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  29.21 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.41 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  32.48 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  31.01 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  31.01 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  30 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.12 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.48 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  29.43 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  29.71 
 
 		 379 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  31.14 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  30.07 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  28.03 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  30.9 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  29.09 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.91 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.36 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.39 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.11 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.39 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  29.47 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  26.64 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  31.1 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.34 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  31.1 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  28.94 
 
 		 371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  27.97 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 		 371 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 		 371 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 		 371 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  27.91 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  28.53 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  28.53 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  28.19 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  27.33 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  28.19 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.19 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  28.19 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  28.19 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  27.91 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  28.19 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  27.65 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>