204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1316 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 366 aa  762    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  82.19 
 
 		 365 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  65.35 
 
 		 366 aa  494  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  57.46 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  61.75 
 
 		 367 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  56.91 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  58.01 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  58.01 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  42.36 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  41.96 
 
 		 375 aa  288  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  40 
 
 		 378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.67 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  36.24 
 
 		 376 aa  272  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  36.03 
 
 		 376 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  35.85 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.89 
 
 		 401 aa  245  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  34.89 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  38.12 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.1 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  33.79 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.51 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.32 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.77 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.43 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.32 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.32 
 
 		 374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.55 
 
 		 372 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.78 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  34.15 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 383 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.42 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.97 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.15 
 
 		 379 aa  212  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.18 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  34.5 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.97 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.43 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  32.04 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.29 
 
 		 375 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.54 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.29 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  31.68 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.77 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  31.48 
 
 		 837 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.05 
 
 		 380 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  32.61 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.77 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.34 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  31.68 
 
 		 865 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  32.5 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  32.5 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  32.22 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.04 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  29.47 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  29.47 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  30.49 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.49 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  32.99 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  32.99 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  32.99 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  30.49 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  32.99 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  30.49 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  30.49 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  30.49 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  33.33 
 
 		 850 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.36 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.81 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  30.18 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  30.18 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  29.92 
 
 		 861 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  32.65 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  29.68 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  30.57 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.8 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  31.29 
 
 		 327 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  31.17 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.91 
 
 		 362 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  31.71 
 
 		 360 aa  182  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.34 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.15 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.97 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  27.98 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  29.8 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.12 
 
 		 363 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  30.81 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.65 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  30.43 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  28.93 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.69 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.86 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  27 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  27.67 
 
 		 408 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.86 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>