178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5402 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 363 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  46.81 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  46.81 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  45.35 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.92 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.84 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  47.54 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.73 
 
 		 378 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  47.18 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.94 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.26 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.9 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.11 
 
 		 374 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  42.94 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.19 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  37.91 
 
 		 837 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.54 
 
 		 390 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  40.34 
 
 		 865 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.03 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.81 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.38 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.26 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  38.66 
 
 		 861 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  39 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  40.86 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.07 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  30.56 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.06 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  39.73 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  32.69 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  31.78 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.12 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.75 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  32.69 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  34.92 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  39.18 
 
 		 850 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.12 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  34.63 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  34.03 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.69 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  32.97 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.16 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.08 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  30.98 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.81 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.9 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.7 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  32.1 
 
 		 375 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.76 
 
 		 374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.25 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.65 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.75 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.23 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.23 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  33.68 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.55 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  30.12 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.23 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  29.64 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.26 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 363 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  30.26 
 
 		 381 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  31.66 
 
 		 370 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  29.32 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  31.23 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  29.45 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.45 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  29.45 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.73 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.16 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.69 
 
 		 401 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 		 372 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  29.13 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 		 372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.14 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.15 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  29.13 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  29.29 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  31.6 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.14 
 
 		 380 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  27.63 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  30.79 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  31.29 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  24.06 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  28.33 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.3 
 
 		 379 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  27.1 
 
 		 387 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.11 
 
 		 374 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  27.22 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.13 
 
 		 374 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  27.22 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>