167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2310 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 383 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.97 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.06 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  44.8 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.59 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.03 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.58 
 
 		 398 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.94 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.08 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.23 
 
 		 378 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  40.45 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  40.45 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.81 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  45.54 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  44.73 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  42.73 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.94 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.89 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  38.42 
 
 		 865 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.37 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.14 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  37.97 
 
 		 861 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.72 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.87 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.37 
 
 		 409 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.24 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.31 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.19 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  34.42 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  38.66 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  36.68 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  32.1 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.15 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  30.35 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.08 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  33.06 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  30.67 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  31.35 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  29.71 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  30.35 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  32.13 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.88 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  37.03 
 
 		 850 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.56 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.72 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  35.48 
 
 		 837 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.18 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  26.81 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.02 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  29.84 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  29.51 
 
 		 371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  30.47 
 
 		 377 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.86 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  30.47 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  32.01 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.57 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  33.22 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.35 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  31.96 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  29.13 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.23 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  29.13 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.99 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 371 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 371 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 371 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 371 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.66 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.16 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  31.25 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  27.83 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 371 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  29.35 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  31.63 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  29.53 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.77 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.71 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.6 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  29.01 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  28.24 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  29.01 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  28.67 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  29.19 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  29.21 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  29.58 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  28.97 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>