179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9080 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  100 
 
 		 386 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  58.45 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  60.45 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  47.9 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  50 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.16 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.97 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  45.79 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  45.79 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.35 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  41.42 
 
 		 837 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.86 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.51 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  39.45 
 
 		 861 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.9 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.61 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  40.33 
 
 		 865 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  44.51 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  43.62 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  40 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.71 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.04 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.55 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.44 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.2 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  40.61 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.38 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  38.52 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  35.77 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  39.32 
 
 		 850 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.27 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.05 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  32.3 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  34.37 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.39 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  33.8 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  35.64 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.01 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.24 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  33.05 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  30.73 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.52 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  30.92 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  30.23 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  32.65 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.75 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  34.23 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  33.6 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.66 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.66 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.29 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.41 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.79 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.22 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.43 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.04 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  32.23 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.97 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.77 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  30.9 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  32.32 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.68 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  32.32 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  32.32 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  31.88 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.79 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.35 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.69 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  30.46 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  32.07 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.95 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  31.97 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  31.53 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.36 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.66 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.9 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.52 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  31.09 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  28.96 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  30.97 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.65 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.75 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.58 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.62 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  30.65 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  30.65 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.11 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  30.6 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.82 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.47 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.96 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  31.31 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  28.82 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  28.82 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.82 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  28.82 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  28.82 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  28.82 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  30.57 
 
 		 379 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>