165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4596 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 390 aa  763    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  50 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.43 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  46.41 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.9 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.36 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.62 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  42.42 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  42.42 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.59 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  41.32 
 
 		 837 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.54 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.37 
 
 		 374 aa  232  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  40.9 
 
 		 861 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.05 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.54 
 
 		 363 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  41.18 
 
 		 865 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  41.96 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.9 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.96 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  41.87 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.78 
 
 		 409 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.5 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.57 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.83 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  44.38 
 
 		 365 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.06 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  38.72 
 
 		 850 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.22 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  38.96 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  35.47 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  35.65 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.19 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  30.29 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.67 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  39.62 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.94 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  32.52 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.69 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  32.71 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  41 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.54 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  34.57 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  34.04 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  33.6 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  30.27 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.51 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.59 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.43 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.39 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  32.75 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.07 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.28 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.28 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.06 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.97 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.9 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.06 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.87 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  33.42 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.87 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.87 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  31.16 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  34.5 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.08 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31 
 
 		 383 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.78 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.76 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  30.56 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.54 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.62 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  31.03 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  30.07 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  30.46 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.27 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.83 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  32.21 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  28.67 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  28.67 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.2 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  28.29 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.23 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  28.12 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  24.52 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 372 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.31 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 371 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.09 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  28.09 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>